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  • 本申请公开一种基于多组学数据整合的生物标志物预测系统、存储介质及方法,涉及数据处理和生物信息学技术领域,系统用于对所述特征数据进行基因突变、CNV差异、转录组表达谱分析,识别与生物标志物状态相关的差异表达基因,得到差异表达基因集合;基于该基...
  • 本发明公开了一种基于深度学习模型筛选影响病毒宿主适应性关键突变的装置及方法,包括如下步骤:1)基于指定的病原体种类,收集病原体的基因序列数据和采用宿主信息,并对收集到的数据进行预处理,构建模型训练数据集和测试数据集;2)对收集到的序列数据进...
  • 本发明涉及一种参考样本的筛选方法、计算设备及程序产品。该方法包括:确定参考基因组的多个分析区间,所述多个分析区间包含关于指定同源基因家族中各成员基因的至少一个绝对同源区间及至少一个差异区间;基于待测样本测序数据,确定所述待测样本在各分析区间...
  • 本发明属于肿瘤分子诊断和生物信息分析技术领域,涉及一种急性淋巴细胞白血病MRD监测的高通量测序方法和系统。通过采用带唯一分子标识符和/或双链标签的靶向测序、基于本底噪声谱的误差建模和统计/机器学习伪变异过滤,实现对IG/TCR克隆及相关基因...
  • 本发明属于基因鉴定技术领域,公开了一种整合多组学数据增强基因组预测与候选基因鉴定的方法,本发明候选基因识别通过多层证据整合进行验证,包括基于基因贡献评分的优先排序、功能富集分析、泛基因组网络验证和CRISPR/Cas9实验验证。在一个包含完...
  • 本发明涉及基因表达技术领域,具体公开了一种基于静态基因表达数据的代谢通量预测方法及系统,所述方法包括获取代谢网络结构及其对应的静态基因表达数据;针对代谢网络中的每一目标代谢反应,构建对应的通量预测模型;所述通量预测模型包括双输入编码器和解码...
  • 本发明涉及生物信息学与人工智能分析领域,具体涉及一种基于随机森林模型的染色体异常检测系统及方法;本发明对净化后的文件进行变异检测,识别碱基替换、插入及缺失事件,并计算各变异位点的等位基因频率,生成标准化的VCF格式文件、将变异位点的等位基因...
  • 本发明涉及生物信息学与高通量测序数据分析技术领域,具体涉及一种基于VAF分布热图的基因组异常检测系统及方法;本发明获取待检基因组样本数据和对应的参考基因组样本数据,对VAF值进行折叠处理,进行二维分箱,得到计数矩阵,进行高斯平滑构建VAF分...
  • 本发明属于生物医学信息技术、癌症基因组学及临床诊断技术领域,公开了基于多维度证据自动评级肿瘤体细胞突变致癌性的方法与装置。该方法通过获取待评级变异数据并进行标准化注释,基于预设评级规则集自动整合人群频率、癌症热点、功能性实验、预测信息及计算...
  • 本发明公开一种基于长短期记忆网络的蛋白质结构域功能预测方法、装置、终端设备及存储介质,方法包括:获取待测蛋白质氨基酸序列,对待测蛋白质氨基酸序列进行编码得到已编码序列;将已编码序列输入双向长短期记忆网络,双向长短期记忆网络通过前向LSTM从...
  • 本申请涉及一种染色体外环状DNA鉴定方法、装置、计算机设备和计算机可读存储介质,方法包括:获取待测样本及所述待测样本的测序数据;对所述捕获片段进行分割,得到位于第一片段区间的第一片段矩阵以及位于第二片段区间的第二片段矩阵;根据第一片段的序列...
  • 本发明公开了一种基于多粒度融合的药物‑靶标结合亲和力预测方法,其包括S1提取药物SMILES字符串的特征表示及Morgan指纹和Avalon指纹,之后对特征表示和两个指纹进行融合,得到药物特征表示;S2提取蛋白质序列的k‑mer频率特征,并...
  • 本发明涉及抗菌新材料技术领域,具体涉及一种计算机辅助设计抗菌肽的方法、抗菌肽及其应用。本发明提供了一种计算机辅助设计抗菌肽的方法,包括以下步骤:通过滑动窗口法对原始多肽处理生成候选九肽序列,采用基于概率的氨基酸替换策略对每个候选九肽序列进行...
  • 本发明涉及药物靶标亲和度预测领域,尤其涉及一种药物靶标亲和力预测方法及系统。本发明对药物的SMILES序列和蛋白质的氨基酸序列预处理,生成相似性图和分子结构图;然后,将分子结构图和相似性图馈送到多分支骨干网络中,其中包括药物分支和蛋白质分支...
  • 本发明公开了一种快速高效的PRPS2蛋白抑制剂的筛选方法,涉及药物化学技术领域。本发明通过药效团模型与分子对接的级联验证机制,有效克服了单一打分函数导致的假阳性问题;并通过构象与离子态枚举保障了真实生物活性构象的捕获概率;最后通过化学聚类引...
  • 本发明涉及一种蛋白质结构预测模型及其构建方法和应用。本发明基于PyTorch框架构建端到端蛋白质结构预测系统,整合多序列比对信息和模板邻接图,进行结构信息回收与迭代优化,提升局部和全局一致性,逐步提升结构预测精度,模块化设计支持不同蛋白质家...
  • 本发明公开了蛋白质突变体的设计、筛选及其表达量的预测方法、系统及装置。本发明使用Ascend 910AI处理器,通过构建基于Transformer的蛋白质预训练模型MP‑TRANS并基于此通过迁移学习方式构建蛋白质表达水平预测模型MPB‑E...
  • 本发明公开了一种家禽育种系谱编码方法,该方法首先确定个体的品系码;确定个体的世代码;确定个体的批次码;确定个体的家系编号;确定个体的个体类型码;确定个体的个体顺序号;生成校验码;将所述品系码、世代码、批次码、家系编号、个体类型码、个体顺序号...
  • 本公开提供了一种目标病毒引物生成方法、装置、介质及产品。该方法包括:获取待分析病毒基因组;基于所述待分析病毒基因组的引物设计模式,对所述待分析病毒基因组进行分析,得到引物设计指标值;基于所述引物设计指标值生成适配于所述待分析病毒基因组的目标...
  • 本申请实施例公开了一种测试系统。其中,包括机柜、测试机和搬运装置。通过本申请实施例,测试开始时,多轴机械臂驱动夹爪将集中存放的内存条转移至承载盘的容纳槽内;随后搬运装置移动至机柜附近,多轴机械臂带动夹爪使挂钩勾住测试机上的连接环,将测试机从...
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